Niestety, podatek od czynności prawnych (PCC) zapłacony przy wniesieniu (lub podwyższeniu) wkładu do spółki komandytowej nie może być uznany za koszt uzyskania przychodu z działalności gospodarczej. Oznacza to, że w takiej sytuacji wydatki na PCC nie mogą być potrącane z przychodami z działalności gospodarczej generowanymi przez spółkę komandytową.
PCC będzie mógł zostać uznany za koszt uzyskania przychodu jedynie w razie sprzedaży ogółu praw i obowiązków w spółce komandytowej lub przy wystąpieniu ze spółki.
Takie stanowisko zajmują zarówno organy podatkowe, m.in. w interpretacji Dyrektora IS w Warszawie z dnia 8.01.2010 r. sygn. IPPB1/415-764/09-8/ES czy w interpretacji Dyrektora IS w Bydgoszczy z dnia 3.03.2008 r. sygn. ITPB1/415-657/07/PS, jak również sądy administracyjne m.in. WSA w Bydgoszczy w wyroku z 21.10.2010 r., sygn. I SA/Bd 774/10 i WSA w Łodzi w wyroku z 23.06.2009 r., sygn.I SA/Łd 19/09 utrzymany w mocy przez NSA wyrokiem z 23.03.2011 r., sygn. II FSK 1974/09.